Apteka Pod Orłem liczy sobie ponad sto lat. Pierwszym jej właścicielem był Józef Pankiewicz, a po nim jego syn Tadeusz. Gdy w marcu 1941 r. Niemcy utworzyli w Podgórzu getto dla krakowskich Żydów, apteka Pankiewicza była jedyną, która znalazła się w jego obrębie, a jej właściciel jedynym Polakiem mającym prawo do stałego w nim przebywania. Apteka stała się miejscem spotkań żydowskich intelektualistów, naukowców i artystów przebywających w getcie. W ekspozycji zaakcentowano historyczność miejsca, które znalazło się w samym centrum krakowskiego getta. Jest zaaranżowany fragment starej apteki, w miejscu, gdzie rzeczywiście się znajdowała. Ekspozycja obejmuje czas zagłady; zbudowana z fotografii, dokumentów, planów i eksponatów muzealnych. Dopełnieniem są krótkie filmy archiwalne na temat życia społeczności żydowskiej w międzywojennym Krakowie, w getcie i obozie koncentracyjnym w Płaszowie.
Jeden z filmów zatytułowany "Życie Żydów w Krakowie" nakręcono przed wybuchem wojny, drugi "Przesiedlenie do getta krakowskiego" nakręcony został na potrzeby niemieckiej propagandy. Dostępny jest również dział multimedialny w języku angielskim i polskim: archiwa zawierające zarówno zdjęcia jak i dokumenty z okresu wojny, historię apteki, biografię Tadeusz Pankiewicza i elektroniczną księgę gości.
